Sus comienzos datan del siglo XIX, cuando el presidente Sucre decretó la creación de la rama marítima de las Fuerzas Armadas Bolivianas. Al ser una fuerza fluvial, no tiene fragatas u otro tipo de buque marítimo; se centran en los buques (de gran calado) y lanchas fluviales, ofreciendo apoyo logístico y transporte.
Se encargan de proteger y vigilar el territorio acuífero de Bolivia, sus ríos y lagos.
